Το χωριό πήρε το όνομά του, μετά τα λουτρά που βρέθηκαν στην περιοχή.
Ανάμεσα στα μεγάλα κτίρια που μπορείτε να δείτε εδώ, θα βρείτε το Δημοτικό κτίριο που χρησιμοποιείται από την πρώτη κυβέρνηση, το 1821.
Στην αρχαιότητα πίστευαν σε κρητικό Δία και του Απόλλωνα στους Δελφούς, μερικά μέτρα από το χωριό μπορείτε να δείτε μέρος της αρχαίας πόλης και το ναό του Απόλλωνα. (βλ. βίντεο παρακάτω)
Το 1821 η έδρα της η καγκελάριος της Σφακίων και ίδρυσε ένα νοσοκομείο, που έσωσε χιλιάδες τραυματίες μαχητές.

 

 loutro gravure
«Στο λιμάνι του Φοίνικα, που σήμερα ονομάζεται Λουτρό, βλέπουμε μια αρχαία πόλη κατεστραμμένη, που οι κολόνες της είναι σπαρμένες στο έδαφος. Στις καλύβες των χωρικών βρήκα σαρκοφάγους από πολύ λευκό μάρμαρο, από τις οποίες τα γουρούνια έτρωγαν το χυλό τους. Είδα πολυάριθμες προτομές αγαλμάτων ακρωτηριασμένων, ανάμεσα σε ερειπωμένα οικοδομήματα από μάρμαρο...».
Eνας γύρος της Kρήτης στα 1415: Xριστόφορου Mπουοντελμόντι